More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2859 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 206 aa  94.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  48.48 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 280 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.31 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 260 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 241 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  41.07 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  40.68 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  46.15 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2860  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 251 aa  51.2  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  44.26 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  39.68 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  46 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1663  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.319165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.23 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 269 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  32.63 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>