More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4763 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  93.03 
 
 		 201 aa  344  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  58.76 
 
 		 195 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  61.08 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  54.4 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  50.51 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  46.94 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  46.39 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  43.46 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  38.12 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  41.67 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  32.67 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  36.27 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  39.29 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.56 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2085  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.839417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  30.19 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>