105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4052 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 190 aa  157  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 207 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 207 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  52.87 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  53.5 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  54.11 
 
 		 197 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 215 aa  147  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 222 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 206 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 206 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 195 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 220 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  49.68 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  50.66 
 
 		 194 aa  130  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  49.07 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  45.4 
 
 		 210 aa  120  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  45.93 
 
 		 215 aa  110  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  40.99 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 193 aa  95.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 363 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 425 aa  84  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 220 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  36.03 
 
 		 390 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 391 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  29.79 
 
 		 403 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 385 aa  57.4  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 451 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 451 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 393 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 193 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 470 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 412 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 412 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 412 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 424 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 198 aa  44.3  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 201 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 210 aa  43.9  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 227 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 225 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 220 aa  41.2  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 232 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>