More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3131 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  100 
 
 		 403 aa  793    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 408 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 451 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 451 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 363 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 394 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 394 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  30.62 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  37.45 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 393 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 193 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 309 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 195 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 204 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 194 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 190 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 195 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  27.89 
 
 		 210 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 196 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 216 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 206 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 195 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 212 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  39.51 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 220 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 206 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 230 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 287 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  28.37 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 196 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 226 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 194 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 216 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 193 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 200 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 218 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 218 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 221 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 237 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 241 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 206 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 224 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 243 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 206 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>