More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3375 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  84.73 
 
 		 211 aa  347  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  72.55 
 
 		 204 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  71.36 
 
 		 201 aa  304  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  71.72 
 
 		 201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  71.72 
 
 		 201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  71.72 
 
 		 201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  71.72 
 
 		 201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 201 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 201 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  71.92 
 
 		 202 aa  298  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  72.08 
 
 		 202 aa  296  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  70.56 
 
 		 199 aa  292  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 199 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 199 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 199 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  62.12 
 
 		 207 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  62.12 
 
 		 207 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  61.62 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  46.23 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  43.15 
 
 		 208 aa  147  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 260 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 233 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  22 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 770 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  37.8 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>