More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3668 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  92.89 
 
 		 204 aa  383  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  85.93 
 
 		 199 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  85.93 
 
 		 199 aa  367  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  85.93 
 
 		 199 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  85.93 
 
 		 199 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  85.43 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  85.43 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  85.43 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  85.43 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  85.43 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  83.58 
 
 		 201 aa  360  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  82.59 
 
 		 201 aa  357  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  82.09 
 
 		 201 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  82.09 
 
 		 201 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  82.09 
 
 		 201 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  82.09 
 
 		 201 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  82.09 
 
 		 201 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  72.28 
 
 		 211 aa  309  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  56.72 
 
 		 215 aa  225  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  38.58 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 260 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.23 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>