More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2002 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  74.6 
 
 		 191 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  70.68 
 
 		 191 aa  293  9e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  64.92 
 
 		 192 aa  260  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  55.85 
 
 		 194 aa  214  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 199 aa  209  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 189 aa  165  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  30.61 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  28.57 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  34.65 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  24.02 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.02 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.02 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.02 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.02 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.02 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.28 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  25.44 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>