256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2752 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2752  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 193 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 218 aa  95.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  34.23 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  29.32 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  30.21 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 125 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  45.28 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3875  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  45.1 
 
 		 258 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 283 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 240 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 275 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  42 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.71 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 308 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  28.71 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>