More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4972 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 317 aa  610  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 199 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 260 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 223 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 226 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 206 aa  52.8  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  47.37 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  52.94 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 192 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 201 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 225 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  34 
 
 		 200 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 215 aa  50.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 232 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 206 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 225 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 184 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  32.39 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  38.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 193 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.45 
 
 		 198 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 193 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 224 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 185 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 189 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 194 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 199 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>