100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1026 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1026  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0088  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3610  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7122  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  41.94 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.12 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  48.94 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  32.14 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 260 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  25.61 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 195 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 106 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 189 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 213 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1851  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 162 aa  42.4  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 196 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 190 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 190 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 190 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 232 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  20.89 
 
 		 190 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  20.89 
 
 		 190 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  20.89 
 
 		 190 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  31.65 
 
 		 195 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  20.89 
 
 		 190 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>