More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3728 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  52.63 
 
 		 231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  52.15 
 
 		 231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  51.46 
 
 		 235 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  52.71 
 
 		 242 aa  220  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  48.94 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 259 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.58 
 
 		 182 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 260 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  37.04 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  38 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 391 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>