96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5853 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  47.12 
 
 
242 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
224 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  50.8 
 
 
237 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  50.29 
 
 
235 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  50.84 
 
 
231 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  50.28 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
239 aa  178  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  49 
 
 
242 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  47.43 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 
239 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
217 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
219 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
200 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
187 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
257 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
197 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 
192 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  38.46 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
196 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
199 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
260 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
125 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
236 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.67 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  37.68 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  43.1 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
198 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  31.43 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
176 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
192 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
141 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
195 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
266 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
230 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 
203 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 
199 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  29.03 
 
 
241 aa  41.6  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  35.59 
 
 
218 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
204 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
213 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
214 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  34.94 
 
 
225 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
221 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  34.94 
 
 
225 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
230 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 
216 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  34.94 
 
 
225 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>