More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0649 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 191 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 189 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 275 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  41.38 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  40.79 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  42 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  41.54 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 424 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>