91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0081 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  31.37 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  25.77 
 
 		 204 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  35.96 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 191 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  29.89 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  44.23 
 
 		 189 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 179 aa  42  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 208 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 206 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 199 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 196 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 237 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 213 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 216 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  22.08 
 
 		 205 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 194 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 234 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 186 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 191 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 190 aa  41.6  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>