More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3959 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  426  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.18 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.46 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.03 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.92 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.92 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.92 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.451581 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.92 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.92 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 236 aa  51.6  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 310 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.92 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0386851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.8 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.11 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.23 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  35.94 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.94 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.94 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.94 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  45.83 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.94 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.94 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.94 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.52 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.52 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  35.94 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  43.4 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 388 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  35.71 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 497 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.33 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.33 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>