244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0951 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  54.27 
 
 		 237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  53.2 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  52.71 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 242 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 239 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  49 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 346 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 317 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  37.1 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  50.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  37.88 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 207 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 125 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  33.61 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  46 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 406 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  30.99 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>