More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2950 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  44.88 
 
 		 242 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  38.94 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.85 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  25.99 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  30.1 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  32.43 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  27.88 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  40.32 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  31.53 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 400 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 510 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>