More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 228 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 192 aa  84.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  36.94 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  36.26 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  30.57 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  31.46 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 259 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  46.59 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  30.6 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  27.96 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  35.76 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  31.15 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  28.33 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  48.61 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>