25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3220 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  100 
 
 		 145 aa  288  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 200 aa  186  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 223 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 202 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 222 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 222 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 222 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 211 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 207 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 195 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 195 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 209 aa  114  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 195 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 196 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 200 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 209 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 194 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 206 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 206 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 210 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 208 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 203 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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