116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2470 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
209 aa  410  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  95.22 
 
 
635 aa  388  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 
230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 
214 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1563  transcriptional regulator, TetR family  53.66 
 
 
207 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5188  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375303  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
200 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  39.74 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  50 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.59 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  26.59 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  41.67 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
178 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  40.79 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  45.1 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
190 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  41.51 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  51.06 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
268 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 
184 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3965  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396199  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6395  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  27.53 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
250 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  43.4 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  43.4 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  43.64 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
214 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 
190 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
193 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 
215 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
193 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
207 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
193 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
214 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  53.66 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
249 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32400  transcriptional regulator, tetR family  43.48 
 
 
216 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
228 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
228 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3661  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
306 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 
200 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>