84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2892 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 635 aa  1155    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  95.22 
 
 		 209 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  58.45 
 
 		 230 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  60.94 
 
 		 214 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1563  transcriptional regulator, TetR family  53.69 
 
 		 207 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5188  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 220 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 194 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 193 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 196 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 192 aa  54.7  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 200 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 211 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  42.25 
 
 		 186 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 207 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 203 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 223 aa  51.6  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 186 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 195 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 200 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 195 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  50.8  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 190 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 268 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 195 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 205 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  38.1 
 
 		 186 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 205 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 197 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 178 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 207 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 242 aa  48.5  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 240 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 178 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 178 aa  48.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 178 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 178 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 200 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 208 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 200 aa  47.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 290 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 178 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.47 
 
 		 178 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  27.47 
 
 		 178 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 232 aa  47.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  36.99 
 
 		 222 aa  47.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 225 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 198 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  38.16 
 
 		 210 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  38.16 
 
 		 210 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 197 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 206 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 226 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 232 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  35.85 
 
 		 214 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 204 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 244 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  55 
 
 		 200 aa  45.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  41.51 
 
 		 195 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  45.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 205 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  26.74 
 
 		 2914 aa  44.7  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 238 aa  45.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 207 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 189 aa  44.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 218 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 221 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 215 aa  44.3  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 203 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 200 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 228 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  43.9  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>