More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4377 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  80.98 
 
 		 205 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 201 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  55.61 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 204 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 203 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  49.72 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 204 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  48.39 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  45.54 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  41.99 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  29.14 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
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NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  26.46 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  30.46 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  32.81 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  24.24 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1420  hypothetical protein  43.64 
 
 		 101 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  30.5 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  35.06 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
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