54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0393 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0393  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  430  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0613  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  135  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000642409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  27.4 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  22.79 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  20.35 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  20.88 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  26.39 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 199 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 211 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  18.59 
 
 		 198 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 208 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  24.88 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>