99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1631 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 246 aa  47.8  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  26.97 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  42.11 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 272 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  25.64 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5281  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4913  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.763615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  36.21 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5002  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.827142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2597  hypothetical protein  30.09 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323808  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  26.97 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  25.67 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 343 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  28.4 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 188 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 268 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  42.4  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 188 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 278 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  32.26 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 186 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 182 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 182 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 182 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 243 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 307 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 252 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  23.68 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  36 
 
 		 243 aa  41.2  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 247 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 224 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>