44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2597 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2597  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323808  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2128  putative transcriptional regulator, TetR family  51.98 
 
 		 204 aa  208  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2121  hypothetical protein  49.26 
 
 		 204 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  29.86 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  29.86 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  29.17 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.17 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3366  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402677  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  32.5 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2590  hypothetical protein  30.4 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  31.25 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 272 aa  45.4  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  30.65 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 343 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5281  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5002  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.827142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4913  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.763615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  39.39 
 
 		 168 aa  42  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 216 aa  42  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 279 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 272 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>