More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3644 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 420 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 540 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  22.39 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  23.24 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 424 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  38.61 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  39.39 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  27.32 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1663  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.319165 
 
 
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NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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