More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6489 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  76.28 
 
 		 215 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2999  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.03228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.11 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0679  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  28.66 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  28.1 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.68 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.96 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  31.97 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.22 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2577  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  36.97 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>