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for query gene Sden_3614 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  73.81 
 
 		 217 aa  324  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  69.95 
 
 		 215 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  70.95 
 
 		 215 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  70.95 
 
 		 215 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  70.95 
 
 		 215 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  70.95 
 
 		 215 aa  315  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  69.48 
 
 		 215 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  69.48 
 
 		 215 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 215 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 215 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  66.2 
 
 		 220 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  67.79 
 
 		 211 aa  296  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  68.1 
 
 		 213 aa  292  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  67.62 
 
 		 215 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 218 aa  287  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  63.81 
 
 		 225 aa  278  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  42.71 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  41.51 
 
 		 214 aa  171  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  35.98 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  33.17 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  32.52 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  33.13 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  91.3  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 247 aa  88.2  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  28.16 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  30.95 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
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NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  23.93 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
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NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
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