232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1919 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1919  regulatory protein TetR  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543101  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  28.33 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  26.5 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  32.03 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 173 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  30.63 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  46.88 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  46.03 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0628  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  30.46 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  31.02 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>