More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5188 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5188  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  31.98 
 
 		 635 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1563  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  45 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  33.08 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  49.09 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  42.42 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  43.86 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.19 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  32.73 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  39.68 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>