34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2514 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  42.21 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  26.99 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  23.27 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2703  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00115407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 243 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 232 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5669  regulatory protein TetR  26.32 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 195 aa  42  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  26.25 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 240 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 223 aa  41.2  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>