67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5057 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  75.62 
 
 		 203 aa  307  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  36.59 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  28.16 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4946  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2703  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00115407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3737  hypothetical protein  28.17 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 206 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 227 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 207 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>