29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4946 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4946  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  44.72 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  28.07 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  32.64 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  42.86 
 
 		 226 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 403 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 208 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 231 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 224 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 332 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 226 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>