68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4387 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  32.63 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 240 aa  47.8  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  31.73 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 228 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  35.94 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 220 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4946  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 225 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 199 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 307 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 226 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  41.2  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>