37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4621 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 191 aa  111  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  29.94 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  29.09 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  28 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2703  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00115407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  35.14 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 250 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  31.43 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>