28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2002 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  52.58 
 
 		 200 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 198 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  27.47 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 191 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  38.24 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 280 aa  42  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 245 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>