More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1067 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  23.86 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  20.12 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  23.3 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  23.78 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  23.13 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  23.7 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  24.44 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  23.3 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  23.3 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  23.3 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  22.73 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  22.73 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  23.19 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  20.93 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  33.93 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  21.84 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  23.36 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  21.49 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>