60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2431 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 207 aa  92  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  29.65 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2703  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00115407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  27.27 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  24.29 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3737  hypothetical protein  27.82 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596128  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  32.04 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 298 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.35 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.6 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.6 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.6 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.6 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.6 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.46 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 197 aa  42  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  23.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  23.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  22.62 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 269 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>