More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2515 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  463  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 227 aa  232  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  47.27 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  39.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  38.33 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  31.13 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  40.51 
 
 		 182 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  42.03 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  34.55 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  35.14 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>