More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  44.39 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5669  regulatory protein TetR  32.97 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  48.98 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  41.94 
 
 		 235 aa  51.2  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 234 aa  51.2  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  27.78 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  27.78 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  48.98 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  36.51 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  39.22 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  27.01 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  23.63 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>