28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5659 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  74.65 
 
 		 220 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  33.94 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0147  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  30.53 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28950  Transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  39.71 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  28.68 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 197 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 216 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>