83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1789 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1789  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  373  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00598195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  35 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.08 
 
 		 237 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 221 aa  42  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 189 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 204 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 198 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 231 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 190 aa  42  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>