102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4392 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4392  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  85.86 
 
 		 233 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 218 aa  150  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 231 aa  95.5  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  29.45 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.82 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  33.6 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 237 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 251 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 266 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  18.57 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 184 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 210 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 201 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 233 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  43.18 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 231 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 185 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>