More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1662 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  45.96 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  41.85 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  36.74 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 229 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 280 aa  91.3  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 246 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  62.5 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 289 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  51.25 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  34.46 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  61.11 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  38.28 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2446  TetR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00126454  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4093  putative transcriptional regulator, TetR family  42.74 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  35.19 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  42.53 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  44.64 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  39.44 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  35.37 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>