More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0986 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0986  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  55.17 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 		 309 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  37.04 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 272 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 276 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  36.76 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  41.54 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  36.49 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 414 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  25 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 87 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  23.26 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 423 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 240 aa  44.7  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  36.51 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>