99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17920 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  45.64 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  29.75 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  34 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  34.02 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  36.56 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  29.23 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 263 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  34.69 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  27.13 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  32.29 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  34.83 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  22.76 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 273 aa  43.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  35.96 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  35.96 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  29.7 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  35.42 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  35.96 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 249 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  35.42 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  35.96 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  33.71 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  21.6 
 
 		 225 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 192 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 189 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 202 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 240 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 181 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 209 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  29.7 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  27.43 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 271 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>