190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0551 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 220 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 219 aa  304  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  67.27 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  66.06 
 
 		 222 aa  292  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  62.5 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  60.77 
 
 		 247 aa  256  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 251 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 251 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  41.87 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 235 aa  165  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  38.43 
 
 		 241 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 209 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  34 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  28.97 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  29.52 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  32.54 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  30.88 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  29.57 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  37.5 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_0117  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.712391  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
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NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
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NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
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NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  32.23 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
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