44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0672 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0672  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 184 aa  95.9  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  31.69 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0387  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1611  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1762  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1190  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.62 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  19.13 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  21.21 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  30.11 
 
 		 188 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 222 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  21.74 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  23.17 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 219 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 237 aa  41.2  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  20.59 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  21.56 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 236 aa  41.2  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>