45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1190 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1190  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0387  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0672  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1611  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  28.43 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1762  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.08 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  20.86 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.96 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  28.12 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 210 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 264 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 206 aa  42  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 125 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>