199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3421 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3421  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  60.85 
 
 		 212 aa  261  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4895  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1955  putative transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0176094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  26.67 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  32.73 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 175 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  37.5 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  24.09 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  31.29 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  42 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>